- Zarzuela nueva intitulada Cautelas contra cautelas y el rapto de Ganímedes. Fiesta que se representó estrenándose con ella el nuevo Coliseo del Principe. Construido de orden de Su Magestad, (que Dios Guarde) en esta Leal y Coronada Villa y Corte de Madrid. Executáronla ambas compañias. Púsola en música D. Joseph de Nebra, organista de la Real Capilla de S.M., [s.l. : s.n.], 1745, 76 p. ; 15 cm.

- Zarzuela Nueva, intitulada: Para obsequio a la Deydad, nunca es culta la crueldad, y Ephigenia en Tracia: Fiesta, que representó en el Coliseo de la Cruz la Compañia de Joseph Parra el dia 15. de Enero de este año de 1747. La escrivió Nicolas Gonzalez Martinez, quien la dedica a la Excma. Señora Duquesa de Arcos, Maqueda, y Naxera, &c. Compuso la Música Don Joseph de Nebra, primer Organista de la Real Capilla del Rey N.S. con las licencias necessarias, Madrid, [1747]

- Dramma harmónica intitulada: Antes que zelos y amor, la piedad llama al valor, y Achiles en Troya. Fiesta que se ha de executar ... en el coliseo del Príncipe, en este presente año de 1747. La escrivió D. Nicolas Gonzalez Martinez. Puesta en música por Don Joseph Nebra, Madrid : [s.n.], [1747], 43 p. ; 20 cm.

- Zarzuela nueva, intitulada: No hay perjuicio sin castigo. Se ha de representar en el coliseo del Excmo. Sr. Duque de Medina-Celi, con motivo del feliz desposorio del Excmo. Sr. Marqués de Cogolludo, su hijo ... Compuesta por D. Nicolas Gonzalez Martinez. Y puesta en música por D. Joseph de Nebra, primer organista de la Real Capilla de Su Magestad, [s.l. : s.n.], [s.a.], 72 p. ; 17 cm.

- Tocatas y sonata para organo ó clave. Transcripción y estudio: Román Escalas, Zaragoza : Institución Fernando el Católico, Sección de Música Antigua, 1987, 36 p. (Col. Tecla Aragonesa, I)

- "Misa breve a 8 con violines y oboes unísonos y clarín (Mp 868) ; Letanía de Nuestra Señora a 8 (E 69-9)", en La música en la Real Capilla de Madrid (siglo XVIII), Madrid : Fundación Amigos de Madrid, 1992

-Obras inéditas. Estudio y transcripción de Soledad Alvarez Martínez, Zaragoza : Institución Fernando el Católico, 1995 (Col. Tecla Aragonesa, III)

- Cuatro villancicos y una cantatade José de Nebra /1702-1768). Estudio y transcripción Mª Salud Álvarez Martínez, Zaragoza : Institución Fernando el Católico, 1995 (Col. Polifonía Aragonesa, X)

- y ZAMORA, Antonio de: Viento es la dicha de Amor : zarzuela en dos jornadas : (Madrid, 1743-1752), [Valladolid] . V Centenario del Tratado de Tordesillas, 1995

- y CAÑIZARES, José de: Obra Selecta. I. Amor aumenta el valor. Melodrama. Primer acto. Música de José de Nebra. Texto de José de Cañizares. Estudio y transcripción María Salud Álvarez Martínez, Zaragoza : Institución Fernando el Católico, Sección de Música Antigua, 1995, 248 p.

- y GONZÁLEZ MARTÍNEZ, Nicolás: Obra selecta. Música escénica. II : Para obsequio de la Deydad, nunca es culto la crueldad, y Iphigenia en Tracia : Zarzuela/ música de José de Nebra. Texto de Nicolás González Martínez. Estudio y transcripción María Salud Álvarez Martínez, Zaragoza : Institución Fernando el Católico, Sección de Música Antigua, 1997, 382 p.

- Obra selecta. Música litúrgica. I. Misas : Misa "Laudate Nomen Domini" a 8 voces, oboes, violines, viola y bajo continuo / estudio y transcripción María Salud Álvarez Martínez, Zaragoza : Institución Fernando el Católico, Sección de Música Antigua, 1998, 251 p. ; 31 cm.

- Obra selecta. Misa "In viam Pacis" a 8 voces, oboes, violines, viola y bajo continuo / estudio y transcripción María Salud Álvarez Martínez, Zaragoza : Institución Fernando el Católico, Sección de Música Antigua, 1998

- Obra selecta. Vendado es amor, no es ciego / estudio y transcripción María Salud Álvarez Martínez, Zaragoza : Institución Fernando el Católico, Sección de Música Antigua, 1999

- Obra selecta. Música litúrgica. III. Vísperas: "Dixit Dominus", "Beatus vir", "Laudate Dominum", "Magnificat" / estudio y transcripción María Salud Álvarez Martínez, Zaragoza : Institución Fernando el Católico, Sección de Música Antigua, 2001